Návrh zákona bol v rámci medzirezortného pripomienkového konania zaslaný na zaujatie stanoviska 46 adresátom, z  toho na návrh reagovalo 37 subjektov, z ktorých 12 nemalo žiadne pripomienky. Zásadné pripomienky uplatnili Ministerstvo vnútra SR, Ministerstvo životného prostredia SR, Ministerstvo zdravotníctva SR a Úrad priemyselného vlastníctva SR. Návrh zákona sa predkladá bez zásadných rozporov.

V § 181 sa odporúča zakotviť odstupňovanú ochranu vody a pôdy od škody nie malej, značnej škody až po škodu veľkého rozsahu.

Stanovisko: Doplnenie nového trestného činu neoprávneného nakladanie s odpadmi (§ 181f) vychádza z podnetu rezortu životného prostredia, ktorý navrhoval, aby takéto protiprávne konanie bolo trestným činom, ak náklady na odstránenie následku poškodenia sú vyššie ako 1 milión Sk. Keďže predkladateľ vzhľadom na terajšiu systematiku Trestného zákona nechcel uviesť priamo v skutkovej podstate trestného činu konkrétnu výšku rozsahu v korunách, Trestný zákon upravuje dva druhy rozsahu, ktoré v tejto súvislosti pripadajú do úvahy – značný rozsah (100-násobok minimálnej mzdy, t.j. 440 tisíc Sk) a veľký rozsah (500-násobok minimálnej mzdy, t.j. 2,2 mil. Sk). Bola zvolená prvá možnosť. Ak náklady na odstránenie následku poškodení dosahujú rozsah nie malý (6-násobok minimálne mzdy, t.j. cca 27 tis. Sk), nie je dôvod, aby takéto konanie bolo posudzované ako trestný čin a porušenie zákona o odpadoch je postihovateľné pokutami v správnom konaní. V prípade, že by naopak konaním bola spôsobená taká škoda, že jej odstránenie si vyžiada vyššie finančné prostriedky dosahujúce aj sumu veľkého rozsahu, navrhovaná trestná sadzba svojím rozsahom umožňuje adekvátne rozlíšiť a adekvátne potrestať aj takéto konanie.

V § 124 sa odporúča zaradiť osobitné ustanovenie o účinnej ľútosti, ako je to pri nezaplatení dane.

Stanovisko: Neakceptované, keďže takýto návrh bol predmetom návrhu novely Trestného zákona č. 183/1999 Z.z. a nakoniec neprešiel legislatívnym procesom. Ustanovenie o účinnej ľútosti vo vzťahu k § 124 Tr. zák. obsahuje § 66 a prípadné osobitné ustanovenie vo vzťahu k tomuto trestnému činu bude možné upraviť až v rámci rekodifikácie Trestného zákona.

Odporúča § 249c ods. 1 naformulovať obdobne ako § 249d ods. 1.

Žiada nahradiť vyčíslovanie škody iným spôsobom a nie vo vzťahu k minimálnej mesačnej mzde.

Navrhuje doplniť nový trestný čin zákazu klonovania ľudí.

Pri trestnom čine neoprávneného nakladania s odpadmi (§ 181f) sa odporúča, aby tresty za škody spôsobené vplyvom odpadov boli uložené aj za dôsledky dopadu tejto skutočnosti na zdravie ľudí.

Zvážiť navrhované zníženie výšky škody nie nepatrnej z dvojnásobku na výšku minimálnej mesačnej mzdy.

Stanovisko: Je neúnosné, aby pri majetkových trestných činoch (najvypu-klejšie je to pri krádeži a podvodoch) musela byť spôsobená škoda až približne 9.000,- Sk, aby išlo o trestný čin. V súčasnosti je touto výškou v mnohých častiach štátu celomesačný príjem, a preto je nutné túto hranicu výšky škody znížiť.

Ustanovenie § 89 ods. 15 písm. b/ upraviť takto: “b/ zaknihovaný cenný papier”, keďže v praxi nie je sporné, že vecou sú cenné papiere, ktoré majú materializovanú podobu.

V § 181c ods. 1 nahradiť výšku ujmy, ktorá musí byť spôsobená, a to z nie malej (6-násobok minimálnej mzdy) na nie nepatrnú (výšku minimálnej mzdy).

Navrhuje sa doplnenie novej skutkovej podstaty pod označením § 198b s textom – “Kto inému obmedzuje jeho práva a slobody pre národnosť, rasu alebo etnickú príslušnosť, potresce sa odňatím slobody až na jeden rok alebo peňažným trestom” a odôvodnením, že sa “zisťujú prípady obmedzovania práv a slobôd, napr. zákazom vstupu do verejných pohostinských zariadení pre rasu, pričom majiteľ (vedúci pracovník) nemusí na takýto postup verejne podnecovať”.

Navrhuje nové znenie § 150 a § 151, ktorého podstatou je, že pojem uvádzaný v platnom znení skutkovej podstaty “ľahko”, “zjavne” zameniteľné je treba preniesť z posudzovania objektívnej stránky trestného činu do roviny posudzovania subjektívnej stránky.

Navrhuje do § 182 ods. 1 doplniť aj vodorovnú značku.

Do § 234 a § 247 doplniť špecifickú ochranu jadrového a obdobného rádioaktívneho materiálu a do Trestného zákona doplniť nový trestný čin, ktorý by postihoval nedovolený vstup do objektov jadrového zariadenia s úmyslom poškodiť alebo odcudziť jadrový materiál.